اختصاصی نفت آرا،در پی حادثه انفجار در بندر شهید رجایی، اقدامات فوری برای جلوگیری از ورود آلودگی‌های زیست‌محیطی به آب‌های خلیج فارس انجام شد. یکی از مهم‌ترین تهدیدات ناشی از این حادثه، احتمال ورود پساب‌های آلوده و ضایعات شیمیایی به دریا بود که با اقدام سریع نهادهای مسئول مهار شد.
در همین راستا، با همکاری سازمان حفاظت محیط زیست و اداره بنادر و دریانوردی هرمزگان، تمام کانال‌های منتهی به دریا مسدود شدند تا از انتقال آلودگی به خلیج فارس جلوگیری شود. به دلیل طول زیاد این کانال‌ها، فرصت مناسبی برای انجام عملیات مهار فراهم شد و این کانال‌ها اکنون به عنوان مخازنی موقت، پساب‌های آلوده را در خود نگه داشته‌اند تا پاکسازی کامل طبق برنامه‌ریزی انجام شود.
همچنین با نزدیک شدن به پایان عملیات اطفای حریق، تیمی از کارشناسان زیست‌محیطی برای بررسی‌های تکمیلی و ارزیابی اثرات زیست‌محیطی حادثه در منطقه مستقر خواهد شد. از آغاز وقوع انفجار، نیروهای محیط زیست به‌صورت میدانی در محل حضور داشته‌اند و تاکنون گزارشی مبنی بر ورود مستقیم ضایعات به آب‌های خلیج فارس دریافت نشده است.
با وجود این، کارشناسان هشدار داده‌اند که دود ناشی از سوختن مواد شیمیایی و انفجار، هرچند به‌طور مستقیم وارد آب نشده، اما می‌تواند اثرات منفی بر محیط زیست منطقه داشته باشد. در حال حاضر اقدام مشخصی برای کاهش این نوع آلودگی ممکن نیست، اما وضعیت به‌طور مستمر رصد و بررسی می‌شود.